최고의 기관차를 꿈꾸는 꼬마 기관차 토마스. 위험에 처한 디젤을 구해준 대가로 육지여행을 상으로 받고, 자신도 모르는 사이에 비밀스러운 전설을 가진 안개섬에 도착한다.