편의점 아르바이트생 미림은 우연한 기회로 짝사랑하는 단골손님 태화의 고양이 나츠메를 잠시 맡아주게 된다. 그리고 그날 밤, 뜻하지 않게 번개를 맞은 미림은 고양이 나츠메의 목소리가 들리기 시작한다.