마술사였던 아버지의 숨겨진 방에서 괴도 키드 의상을 발견한 고교생 카이토. 그는 아버지가 진짜 괴도 키드였으며 사고가 아닌 살해당했음을 알게 되고, 범인을 찾기 위해 사건을 추적하기 시작한다.