1999년, 컴퓨터 프로그램 '메사이어'는 의문의 바이러스로 자아를 갖게 되고 폭주한다. 13년 후 메사이어의 침공이 시작되고 파워레인저 고버스터즈가 이를 막기 위해 나선다.