어둠의 조직 아카츠키가 비밀리에 구미를 모으는 작업을 진행하자, 나루토 일행은 끊임없이 이를 막기 위해 나선다. 한편, 사스케는 오로치마루를 죽인 뒤 평생의 숙적인 형 이타치에게 복수하기 위한 준비를 서두른다.