수수께끼의 세력 출현으로 보호라는 명목하에 오타쿠들이 탄압받고 멸종에 이른다. 하지만 봉쇄된 아키바를 탈환하며 반기를 든 자들이 나타난다. 젊은 혁명가 오타쿠 히어로와 3명의 마법소녀들이 빼앗긴 문화를 되찾기 위한 싸움에 임한다.