외계인과 기계 생명체의 침략으로 괴멸 위기에 빠진 지구를 탈환하기 위해 인류는 반격 작전을 개시한다. 지구로 파견된 요르하 부대의 안드로이드 2B와 9S는 전쟁을 종결하기 위한 최후의 전투를 시작한다.