먼 옛날부터 인간들을 습격해온 이승과 저승의 사이를 흐르는 삼도천에 살고 있는 요괴 집단에 대적하기 위하여 시바 가문의 주군과 그 가신들로 구성된 사무라이전대, 신켄쟈가 있었다. 오랜 세월이 흐른 후, 시바 가문의 현 당주인 시바 타케루는 원래 신켄 레드로서 홀로 싸웠으나, 요괴 집단의 본격적인 공격이 시작되는 것을 느낀 후견인 쿠사카베 히코마는 가신의 자손들로 구성된 네 명의 젊은이를 소집하여, 사무라이전대 신켄쟈를 결성시킨다.