카비온을 흑화시켜 세상을 정복하려는 블랙단이 나타나면서 세상은 위험에 처한다. 이에 카비온을 컨트롤할 수 있는 마스터들이 나타나 블랙단과 맞서 싸우고, 카비온 마스터를 양성하는 아카데미를 창설한다.