겁나 먼 왕국의 해롤드 왕이 위독해지자 슈렉은 피오나의 먼 친척인 아더 왕자를 찾으러 떠난다. 한편, 프린스 챠밍은 슈렉이 없는 틈을 타 동화 속 악당들과 함께 왕국을 차지하려는 음모를 꾸민다.