패트리어트 데이를 기념하는 축제의 현장인 보스턴 마라톤 대회에서 두 번의 폭발이 발생하자 경찰과 FBI는 시민들과 협력하여 테러범의 실체를 파악하기 위한 대대적인 수사를 시작한다.