국가 위기를 틈타 무력으로 일본의 전권을 장악하려는 거대 기업 쿠로다 그룹. 정부 비밀조직 고쿠라쿠는 레이디 닌자라는 이름의 요원들을 양성해 쿠로다 그룹에 맞서려 한다.