케로로를 닮은 기묘한 석상의 수수께끼를 풀기 위해 케로로와 후유키가 모험을 떠난다. 신비로운 이스터섬에 도착한 그들의 앞에 정령 마나와 쌍둥이 이오와 라나, 전설의 악령 아쿠아쿠가 나타난다.