2029년, 총리가 암살되고 쿠사나기 소령은 사이보그 대원들로 구성된 부대를 이끌고 수색에 나선다. 대테러의 배후를 파헤치던 쿠사나기 소령은 충격적인 진실을 마주하게 된다.