自らの故郷を探す旅から地球に帰って来たスーパーマン（ブランドン・ラウス）。故郷が宇宙の塵と化していた事に打ちのめされながらも、犯罪の横行する地球の有様を知り、再びスーパーマンとして復活する。スーパーマンの帰還に沸くメトロポリスの人々。だが、かつての恋人ロイスだけは冷淡だった。彼の事などすっかり忘れ、婚約者リチャードとの間に息子・ジェイソンをもうけていた。ロイスは、5年前に何も告げずに突然姿を消したスーパーマンを必死に忘れようとしていたのだ。一方、仇敵レックス・ルーサーは刑務所を出所し、スーパーマンの故郷・惑星クリプトンの科学技術の結晶であるクリスタルを手に入れていた。水にふれる事で大陸規模の質量に増殖するクリスタル。ルーサーはそれを使って自らが支配者となるべき「新大陸」の創設を企てていた。
