ポジティブなマイク（声：ビリー・クリスタル／日本語吹替版：田中裕二）は、誰よりも人間の子どもを怖がらせられるモンスターを目指しているのに周囲と比べて身体が小さくかわいらしいルックスをしていることに悩んでいた。エリートモンスターになるべく憧れの大学モンスターズ・ユニバーシティに進学するも、大きな体躯のサリー（声：ジョン・グッドマン／日本語吹替版：石塚英彦）をはじめ将来有望なモンスターが多く通っていた……。