인류의 적으로 여겨지는 유레카 세븐에 맞서는 조직 아시드. 조직의 일원 아네모네는 인류의 희망을 짊어진 채 적의 내부로 침입하고, 그 안에서 도미니크와 유레카를 만나게 된다.